L’AFFAT a choisi pour son organigramme un modèle de structure organisationnelle divisionnelle géographique dont le pouvoir suprême réside dans l’assemblée générale de l’association. Elle prevoit ouvrir à travers le monde, des représentations appelées Antenne association AFFAT, ce qui lui permettra d’être au plus près de ses membres et futurs adhérents. Ces antennes qui expriment le besoin de représenter l’association et en font la demande, procèdent à leur enregistrement auprès des l’autorités des pays où elles s’établissent, en accord avec l’association mère. Le conseil d’Administration assure la cohésion par une coordination et une planification de l’ensemble.